Stella Nyanzi đã nhận bằng Cử nhân Nghệ thuật về Truyền thông và Văn học đại học tại Đại học Makerere, nơi cô học từ năm 1993 đến 1996.[1]

Cô nhận bằng Thạc sĩ Khoa học Nhân học Y khoa tại Đại học College London, nơi cô học từ 1999 đến 2000.[1]

Cô đã nhận bằng Tiến sĩ Nhân chủng học tại Trường Y học Nhiệt đới và Vệ sinh Luân Đôn, nơi cô học ngành nhân chủng học xã hội, tình dục, và chính sách thanh niên và sức khỏe từ năm 2003 đến năm 2008 [1]

Cô đã thực hiện nghiên cứu về tình dục giới trẻ ở Uganda, và cả ở Gambia năm 2005.[2]